MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 7063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016588	CTG	2	6	291459	291464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7002	NC_016588	CGG	2	6	291566	291571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7003	NC_016588	CGGC	2	8	291601	291608	0 %	0 %	50 %	50 %	374999725
7004	NC_016588	CGG	2	6	291644	291649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7005	NC_016588	CTC	2	6	291677	291682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999725
7006	NC_016588	TCA	2	6	291694	291699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999725
7007	NC_016588	GCT	2	6	291794	291799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7008	NC_016588	CGG	2	6	291803	291808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7009	NC_016588	GCA	2	6	291844	291849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7010	NC_016588	CTG	2	6	291852	291857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7011	NC_016588	CGG	2	6	291959	291964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7012	NC_016588	CGG	2	6	292037	292042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7013	NC_016588	CGT	2	6	292055	292060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7014	NC_016588	TCA	2	6	292087	292092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999725
7015	NC_016588	GGT	2	6	292116	292121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999725
7016	NC_016588	CTG	2	6	292140	292145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7017	NC_016588	TGCG	2	8	292165	292172	0 %	25 %	50 %	25 %	374999725
7018	NC_016588	ATC	2	6	292188	292193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999725
7019	NC_016588	CGG	2	6	292196	292201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7020	NC_016588	CGG	2	6	292232	292237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7021	NC_016588	CTG	2	6	292248	292253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7022	NC_016588	CGG	2	6	292274	292279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7023	NC_016588	ACG	2	6	292288	292293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7024	NC_016588	CAC	2	6	292298	292303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999725
7025	NC_016588	CGG	2	6	292352	292357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7026	NC_016588	GGT	2	6	292457	292462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999725
7027	NC_016588	GAC	2	6	292571	292576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7028	NC_016588	CGG	2	6	292666	292671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999725
7029	NC_016588	TCG	2	6	292737	292742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7030	NC_016588	CAA	2	6	292769	292774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374999725
7031	NC_016588	CAG	2	6	292781	292786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999725
7032	NC_016588	GGT	2	6	292799	292804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999725
7033	NC_016588	GCC	2	6	292830	292835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999725
7034	NC_016588	ACA	2	6	292861	292866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374999725
7035	NC_016588	GCTCTC	2	12	292874	292885	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374999725
7036	NC_016588	GGGC	2	8	293152	293159	0 %	0 %	75 %	25 %	374999726
7037	NC_016588	CGGT	2	8	293172	293179	0 %	25 %	50 %	25 %	374999726
7038	NC_016588	GAT	2	6	293207	293212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999726
7039	NC_016588	GGCG	2	8	293213	293220	0 %	0 %	75 %	25 %	374999726
7040	NC_016588	ACC	2	6	293289	293294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999726
7041	NC_016588	TGG	2	6	293302	293307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999726
7042	NC_016588	CG	4	8	293371	293378	0 %	0 %	50 %	50 %	374999726
7043	NC_016588	CGC	2	6	293458	293463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999726
7044	NC_016588	GTC	2	6	293534	293539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999726
7045	NC_016588	TGA	2	6	293551	293556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999726
7046	NC_016588	TCGGCC	2	12	293882	293893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374999727
7047	NC_016588	CCA	2	6	293901	293906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999727
7048	NC_016588	GCG	2	6	293917	293922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999727
7049	NC_016588	GC	3	6	293927	293932	0 %	0 %	50 %	50 %	374999727
7050	NC_016588	CAG	2	6	293938	293943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999727
7051	NC_016588	CGA	2	6	294060	294065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999727
7052	NC_016588	TCC	2	6	294068	294073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999727
7053	NC_016588	CGG	2	6	294231	294236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999727
7054	NC_016588	CGC	2	6	294237	294242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999727
7055	NC_016588	TCT	2	6	294249	294254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999727
7056	NC_016588	GCG	2	6	294279	294284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999727
7057	NC_016588	GCC	3	9	294359	294367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999727
7058	NC_016588	TCG	2	6	294410	294415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999727
7059	NC_016588	GAC	2	6	294449	294454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999727
7060	NC_016588	CTGG	2	8	294574	294581	0 %	25 %	50 %	25 %	374999727
7061	NC_016588	GAC	2	6	294664	294669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999727
7062	NC_016588	GCTC	2	8	294822	294829	0 %	25 %	25 %	50 %	374999727
7063	NC_016588	GTC	2	6	294833	294838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999727

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.